漳州七首岩寺大约建于南朝，公元540年。据《漳州府志·与地志中》记载：
石狮岩山，在城南七里，一名南岩山。慎蒙《名山记》云：峰峦奇秀，延袤数里，上多怪石，有若狮子者、有若蟾蜍者，有可梯者，有如门若，状类不一。又有半月池、罗汉峰、超然亭、宝月岩、南泉岩及圆月、石门、龙泉、妙峰、玉泉五庵，以石狮岩为最胜，故以名山。有石刻“狮子岩”三大字，其下清泉一泓，有“止泓”字。郡守韩擢名为“白鹿泉”。傍岩为佛庵，昔无隐禅师居之，畜虎随使，俗名“虎硿岩”。宋李弥逊诗：翠合峰峦万木稠，云擎佛屋出岩幽，秋光不到庭荫树，晓日先明竹外楼。石狮岩下为无隐禅师塔，岩右有石，端好如削，宋刻“薛公桥”，字傍有记，则郡南《通津桥记》，勒在名山者也。近以“修身为本”四字铲之矣。岩前石虎拜石，相传隐师所畜，虎礼拜与此。有石桥、石门。又南泉岩之南，有蝙蝠洞，洞口有万石室。普陀岩有石刻普陀菩萨数像，下拆为玉泉岩，有泉出石下，淡如玄玉，故名。石狮岩之上有石，名罗汉峰，上有超然亭，今废。正德志作揖仙亭。山最高处其下有紫云岩，宋僧雪山创庵，有紫云覆其上。山背有寂照岩。后由于疏于管理，上千年来漳州七首岩寺一直处于荒废破败阶段。
2006年，照光法师任七首岩寺住持，引僧众数人管理七首岩寺，重建寺庙，修葺殿堂。
2009年，常圆法师驻锡七首岩，常年开设禅修课程，并在每年年末设置禅七，吸引了来自全国各地的僧人前来求法修行。
2010年，七首岩寺被评为福建省第二批对台交流重点寺庙。
2013年，在漳州市委市政府的指导下，市城乡规划局对七首岩寺进行规划建设，准备打造七首岩文化公园。
